Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkchP23298 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkchP23298 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkchP23298 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkchP23298 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkchP23298 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms