Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TP20293 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TP20293 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TP20293 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TP20293 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TP20293 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TP20293 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TP20293 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TP20293 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TP20293 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TP20293 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TP20293 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TP20293 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TP20293 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TP20293 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TP20293 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TP20293 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TP20293 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TP20293 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TP20293 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TP20293 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TP20293 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TP20293 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TP20293 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TP20293 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TP20293 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TP20293 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TP20293 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TP20293 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TP20293 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TP20293 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TP20293 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TP20293 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TP20293 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TP20293 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TP20293 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TP20293 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TP20293 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TP20293 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TP20293 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TP20293 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TP20293 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TP20293 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TP20293 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TP20293 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TP20293 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TP20293 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TP20293 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TP20293 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TP20293 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TP20293 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TP20293 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TP20293 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TP20293 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TP20293 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TP20293 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TP20293 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TP20293 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TP20293 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TP20293 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TP20293 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TP20293 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TP20293 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TP20293 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TP20293 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
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TP20293 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TP20293 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TP20293 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TP20293 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TP20293 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TP20293 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TP20293 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TP20293 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TP20293 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TP20293 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TP20293 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TP20293 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TP20293 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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TP20293 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TP20293 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TP20293 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TP20293 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TP20293 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TP20293 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TP20293 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TP20293 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TP20293 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TP20293 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TP20293 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TP20293 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TP20293 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TP20293 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TP20293 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TP20293 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TP20293 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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