Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms