Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms