Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csn1s1P19228 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms