Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RargP18911 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RargP18911 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RargP18911 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RargP18911 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RargP18911 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RargP18911 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RargP18911 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RargP18911 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RargP18911 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RargP18911 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RargP18911 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RargP18911 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RargP18911 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RargP18911 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RargP18911 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RargP18911 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RargP18911 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RargP18911 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RargP18911 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RargP18911 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RargP18911 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RargP18911 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RargP18911 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RargP18911 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RargP18911 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RargP18911 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RargP18911 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RargP18911 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RargP18911 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RargP18911 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RargP18911 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RargP18911 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RargP18911 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RargP18911 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RargP18911 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RargP18911 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RargP18911 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RargP18911 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RargP18911 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RargP18911 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RargP18911 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RargP18911 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RargP18911 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RargP18911 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RargP18911 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RargP18911 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RargP18911 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RargP18911 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RargP18911 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RargP18911 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RargP18911 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RargP18911 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RargP18911 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RargP18911 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RargP18911 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RargP18911 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RargP18911 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RargP18911 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RargP18911 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RargP18911 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RargP18911 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RargP18911 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RargP18911 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RargP18911 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RargP18911 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RargP18911 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RargP18911 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RargP18911 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RargP18911 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RargP18911 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RargP18911 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RargP18911 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RargP18911 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RargP18911 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RargP18911 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RargP18911 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RargP18911 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RargP18911 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RargP18911 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RargP18911 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RargP18911 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RargP18911 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RargP18911 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RargP18911 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RargP18911 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RargP18911 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RargP18911 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RargP18911 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RargP18911 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RargP18911 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RargP18911 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RargP18911 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RargP18911 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RargP18911 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RargP18911 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RargP18911 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RargP18911 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RargP18911 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RargP18911 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms