Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms