Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a1P12813 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms