Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fv4P11370 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fv4P11370 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fv4P11370 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fv4P11370 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fv4P11370 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fv4P11370 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fv4P11370 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fv4P11370 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms