Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd8bP10300 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms