Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb4P10284 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms