Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl2P10148 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl2P10148 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl2P10148 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl2P10148 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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