Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem254bP0DN90 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem254bP0DN90 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem254bP0DN90 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem254bP0DN90 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem254bP0DN90 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem254bP0DN90 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem254bP0DN90 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem254bP0DN90 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem254bP0DN90 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem254bP0DN90 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem254bP0DN90 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms