Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ndufb1P0DN34 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ndufb1P0DN34 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ndufb1P0DN34 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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