Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3P09920 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3P09920 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3P09920 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3P09920 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms