Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc9P09633 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms