Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna9P09235 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms