Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtaP09225 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtaP09225 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtaP09225 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtaP09225 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtaP09225 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtaP09225 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtaP09225 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtaP09225 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtaP09225 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtaP09225 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtaP09225 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtaP09225 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtaP09225 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtaP09225 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtaP09225 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtaP09225 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LtaP09225 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtaP09225 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtaP09225 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtaP09225 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtaP09225 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtaP09225 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtaP09225 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtaP09225 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtaP09225 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtaP09225 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtaP09225 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LtaP09225 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtaP09225 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtaP09225 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtaP09225 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtaP09225 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtaP09225 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtaP09225 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtaP09225 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtaP09225 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtaP09225 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtaP09225 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtaP09225 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtaP09225 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtaP09225 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LtaP09225 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtaP09225 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LtaP09225 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtaP09225 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtaP09225 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtaP09225 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtaP09225 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtaP09225 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtaP09225 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtaP09225 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtaP09225 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtaP09225 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LtaP09225 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtaP09225 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtaP09225 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtaP09225 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtaP09225 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtaP09225 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtaP09225 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtaP09225 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LtaP09225 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtaP09225 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtaP09225 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtaP09225 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtaP09225 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LtaP09225 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtaP09225 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtaP09225 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtaP09225 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtaP09225 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtaP09225 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtaP09225 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtaP09225 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LtaP09225 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtaP09225 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtaP09225 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtaP09225 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtaP09225 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LtaP09225 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtaP09225 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtaP09225 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtaP09225 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtaP09225 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtaP09225 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtaP09225 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtaP09225 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtaP09225 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtaP09225 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LtaP09225 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LtaP09225 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtaP09225 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtaP09225 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LtaP09225 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtaP09225 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtaP09225 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtaP09225 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtaP09225 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LtaP09225 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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