Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb5P09079 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms