Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa4P06798 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa4P06798 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa4P06798 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa4P06798 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa4P06798 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hoxa4P06798 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxa4P06798 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms