Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P04213 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P04213 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P04213 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P04213 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P04213 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P04213 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P04213 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P04213 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P04213 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P04213 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P04213 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P04213 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P04213 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P04213 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P04213 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P04213 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P04213 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P04213 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P04213 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04213 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04213 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04213 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04213 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04213 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04213 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04213 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04213 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04213 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04213 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04213 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04213 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04213 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04213 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04213 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04213 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04213 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04213 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04213 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04213 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04213 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04213 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04213 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04213 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04213 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04213 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04213 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04213 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04213 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04213 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04213 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04213 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04213 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04213 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04213 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04213 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04213 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04213 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04213 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04213 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04213 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04213 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04213 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P04213 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04213 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04213 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04213 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04213 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04213 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04213 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04213 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04213 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04213 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
P04213 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P04213 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms