Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04212 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04212 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04212 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P04212 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04212 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04212 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04212 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04212 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04212 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04212 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04212 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04212 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04212 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04212 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04212 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04212 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04212 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04212 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04212 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04212 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04212 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04212 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04212 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04212 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04212 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04212 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04212 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04212 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04212 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04212 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04212 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04212 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P04212 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04212 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P04212 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04212 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04212 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04212 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04212 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04212 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P04212 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04212 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P04212 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P04212 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P04212 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P04212 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P04212 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P04212 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P04212 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P04212 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P04212 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P04212 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P04212 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P04212 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P04212 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P04212 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P04212 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P04212 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P04212 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P04212 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P04212 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
P04212 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P04212 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04212 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04212 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04212 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04212 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04212 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04212 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04212 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04212 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04212 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04212 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04212 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04212 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04212 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04212 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04212 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04212 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04212 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04212 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04212 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04212 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04212 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04212 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04212 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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