Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01672 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01672 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01672 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P01672 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01672 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01672 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01672 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P01672 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01672 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01672 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01672 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P01672 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01672 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01672 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01672 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01672 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01672 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01672 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01672 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01672 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01672 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
P01672 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01672 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01672 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01672 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01672 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01672 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01672 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01672 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01672 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01672 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P01672 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01672 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01672 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01672 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01672 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01672 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01672 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01672 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01672 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01672 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01672 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01672 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01672 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01672 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01672 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01672 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01672 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01672 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01672 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01672 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01672 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01672 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01672 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01672 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01672 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01672 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
P01672 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01672 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01672 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01672 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01672 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01672 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01672 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01672 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01672 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01672 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01672 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01672 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01672 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01672 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01672 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01672 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01672 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01672 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01672 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01672 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P01672 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01672 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01672 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01672 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01672 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01672 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01672 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01672 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01672 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01672 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01672 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01672 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01672 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01672 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01672 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
P01672 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01672 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01672 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01672 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01672 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01672 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01672 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms