Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01662 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01662 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01662 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01662 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01662 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01662 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01662 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01662 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01662 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01662 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01662 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01662 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01662 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01662 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01662 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01662 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01662 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01662 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01662 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01662 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01662 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01662 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01662 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01662 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01662 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01662 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01662 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01662 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01662 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01662 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01662 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01662 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P01662 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01662 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01662 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01662 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01662 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01662 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01662 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01662 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01662 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P01662 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01662 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01662 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01662 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01662 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01662 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01662 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01662 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01662 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01662 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01662 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01662 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01662 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01662 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01662 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01662 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01662 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01662 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01662 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01662 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01662 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01662 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01662 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01662 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01662 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01662 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01662 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01662 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01662 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01662 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms