Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01661 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01661 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01661 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01661 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01661 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01661 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01661 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01661 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01661 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01661 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01661 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01661 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01661 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01661 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01661 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01661 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01661 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01661 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01661 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01661 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01661 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01661 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01661 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01661 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01661 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01661 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01661 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01661 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01661 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01661 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01661 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01661 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01661 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01661 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01661 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01661 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01661 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01661 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P01661 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01661 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01661 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01661 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01661 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01661 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01661 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01661 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01661 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P01661 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01661 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01661 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01661 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01661 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01661 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01661 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01661 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01661 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01661 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01661 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01661 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01661 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01661 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01661 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01661 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01661 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01661 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01661 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01661 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01661 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01661 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01661 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01661 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01661 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01661 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01661 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01661 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01661 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms