Protein–RNA interactions for Protein: O88848

Arl6, ADP-ribosylation factor-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6O88848 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6O88848 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6O88848 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6O88848 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6O88848 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6O88848 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6O88848 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6O88848 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6O88848 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6O88848 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6O88848 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6O88848 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6O88848 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6O88848 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6O88848 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms