Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BlmO88700 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BlmO88700 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BlmO88700 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BlmO88700 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BlmO88700 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BlmO88700 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BlmO88700 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BlmO88700 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BlmO88700 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BlmO88700 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
BlmO88700 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BlmO88700 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BlmO88700 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BlmO88700 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BlmO88700 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BlmO88700 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BlmO88700 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BlmO88700 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BlmO88700 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BlmO88700 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BlmO88700 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BlmO88700 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BlmO88700 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BlmO88700 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BlmO88700 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BlmO88700 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BlmO88700 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BlmO88700 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BlmO88700 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BlmO88700 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BlmO88700 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BlmO88700 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BlmO88700 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BlmO88700 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BlmO88700 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BlmO88700 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BlmO88700 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BlmO88700 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BlmO88700 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BlmO88700 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BlmO88700 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BlmO88700 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BlmO88700 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BlmO88700 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BlmO88700 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BlmO88700 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BlmO88700 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BlmO88700 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BlmO88700 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BlmO88700 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BlmO88700 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BlmO88700 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BlmO88700 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BlmO88700 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BlmO88700 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BlmO88700 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BlmO88700 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BlmO88700 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BlmO88700 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BlmO88700 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BlmO88700 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BlmO88700 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BlmO88700 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BlmO88700 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
BlmO88700 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
BlmO88700 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
BlmO88700 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
BlmO88700 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BlmO88700 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
BlmO88700 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BlmO88700 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BlmO88700 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BlmO88700 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BlmO88700 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BlmO88700 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BlmO88700 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BlmO88700 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
BlmO88700 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BlmO88700 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
BlmO88700 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BlmO88700 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BlmO88700 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BlmO88700 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BlmO88700 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BlmO88700 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BlmO88700 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BlmO88700 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BlmO88700 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BlmO88700 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BlmO88700 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BlmO88700 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BlmO88700 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BlmO88700 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BlmO88700 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BlmO88700 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BlmO88700 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BlmO88700 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BlmO88700 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BlmO88700 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms