Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Sap30O88574 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sap30O88574 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Sap30O88574 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Sap30O88574 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Sap30O88574 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Sap30O88574 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Sap30O88574 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Sap30O88574 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sap30O88574 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sap30O88574 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sap30O88574 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Sap30O88574 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sap30O88574 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sap30O88574 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sap30O88574 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sap30O88574 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sap30O88574 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sap30O88574 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sap30O88574 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sap30O88574 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sap30O88574 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sap30O88574 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sap30O88574 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sap30O88574 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sap30O88574 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sap30O88574 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sap30O88574 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sap30O88574 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sap30O88574 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sap30O88574 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sap30O88574 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sap30O88574 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sap30O88574 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Sap30O88574 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Sap30O88574 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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