Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CaskO70589 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CaskO70589 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaskO70589 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaskO70589 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaskO70589 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaskO70589 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaskO70589 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaskO70589 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaskO70589 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaskO70589 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaskO70589 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaskO70589 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaskO70589 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaskO70589 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaskO70589 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaskO70589 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaskO70589 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaskO70589 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaskO70589 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaskO70589 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaskO70589 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaskO70589 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaskO70589 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaskO70589 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaskO70589 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaskO70589 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaskO70589 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaskO70589 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaskO70589 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaskO70589 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaskO70589 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaskO70589 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CaskO70589 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CaskO70589 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CaskO70589 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CaskO70589 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CaskO70589 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaskO70589 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaskO70589 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaskO70589 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaskO70589 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CaskO70589 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaskO70589 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaskO70589 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaskO70589 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CaskO70589 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaskO70589 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaskO70589 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaskO70589 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaskO70589 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaskO70589 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaskO70589 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaskO70589 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaskO70589 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaskO70589 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaskO70589 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaskO70589 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CaskO70589 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaskO70589 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaskO70589 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaskO70589 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaskO70589 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaskO70589 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaskO70589 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaskO70589 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaskO70589 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaskO70589 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaskO70589 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaskO70589 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaskO70589 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaskO70589 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaskO70589 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaskO70589 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaskO70589 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms