Protein–RNA interactions for Protein: O70481

Ubr1, E3 ubiquitin-protein ligase UBR1, mousemouse

Predictions only

Length 1,757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr1O70481 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubr1O70481 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubr1O70481 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms