Protein–RNA interactions for Protein: O70238

Rhox6, Homeobox protein PSX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox6O70238 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox6O70238 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox6O70238 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox6O70238 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox6O70238 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox6O70238 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox6O70238 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox6O70238 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox6O70238 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox6O70238 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox6O70238 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox6O70238 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox6O70238 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox6O70238 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox6O70238 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms