Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx3O55144 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms