Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2a2O55143 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2a2O55143 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2a2O55143 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms