Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms