Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copb2O55029 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copb2O55029 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb2O55029 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb2O55029 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copb2O55029 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copb2O55029 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Copb2O55029 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb2O55029 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb2O55029 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb2O55029 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb2O55029 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copb2O55029 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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