Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffbO54788 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffbO54788 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffbO54788 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffbO54788 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffbO54788 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffbO54788 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffbO54788 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffbO54788 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffbO54788 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffbO54788 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffbO54788 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffbO54788 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffbO54788 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DffbO54788 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffbO54788 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffbO54788 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffbO54788 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffbO54788 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffbO54788 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffbO54788 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffbO54788 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffbO54788 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffbO54788 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffbO54788 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffbO54788 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffbO54788 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffbO54788 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffbO54788 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffbO54788 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffbO54788 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffbO54788 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffbO54788 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffbO54788 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffbO54788 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffbO54788 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffbO54788 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffbO54788 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffbO54788 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffbO54788 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffbO54788 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffbO54788 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffbO54788 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffbO54788 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffbO54788 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DffbO54788 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DffbO54788 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffbO54788 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffbO54788 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffbO54788 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffbO54788 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffbO54788 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DffbO54788 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DffbO54788 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffbO54788 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffbO54788 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffbO54788 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffbO54788 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffbO54788 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffbO54788 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffbO54788 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DffbO54788 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffbO54788 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DffbO54788 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffbO54788 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffbO54788 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffbO54788 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffbO54788 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffbO54788 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffbO54788 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffbO54788 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DffbO54788 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms