Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DffaO54786 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DffaO54786 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DffaO54786 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DffaO54786 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DffaO54786 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DffaO54786 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DffaO54786 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DffaO54786 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DffaO54786 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DffaO54786 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DffaO54786 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DffaO54786 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DffaO54786 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
DffaO54786 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
DffaO54786 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DffaO54786 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DffaO54786 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DffaO54786 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DffaO54786 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DffaO54786 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DffaO54786 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DffaO54786 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DffaO54786 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DffaO54786 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DffaO54786 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DffaO54786 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DffaO54786 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DffaO54786 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DffaO54786 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DffaO54786 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DffaO54786 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DffaO54786 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DffaO54786 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DffaO54786 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DffaO54786 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DffaO54786 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DffaO54786 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DffaO54786 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DffaO54786 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DffaO54786 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DffaO54786 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DffaO54786 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DffaO54786 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DffaO54786 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DffaO54786 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DffaO54786 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DffaO54786 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DffaO54786 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DffaO54786 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DffaO54786 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DffaO54786 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DffaO54786 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DffaO54786 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DffaO54786 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DffaO54786 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DffaO54786 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DffaO54786 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DffaO54786 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DffaO54786 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DffaO54786 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DffaO54786 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DffaO54786 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DffaO54786 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DffaO54786 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DffaO54786 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DffaO54786 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DffaO54786 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DffaO54786 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DffaO54786 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DffaO54786 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DffaO54786 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DffaO54786 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DffaO54786 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DffaO54786 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DffaO54786 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DffaO54786 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DffaO54786 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DffaO54786 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DffaO54786 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DffaO54786 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DffaO54786 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DffaO54786 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DffaO54786 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DffaO54786 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DffaO54786 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DffaO54786 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DffaO54786 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DffaO54786 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DffaO54786 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DffaO54786 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DffaO54786 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DffaO54786 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DffaO54786 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DffaO54786 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DffaO54786 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DffaO54786 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DffaO54786 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DffaO54786 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DffaO54786 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms