Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema6aO35464 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms