Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Kcns1O35173 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Kcns1O35173 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kcns1O35173 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kcns1O35173 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kcns1O35173 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kcns1O35173 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kcns1O35173 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Kcns1O35173 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Kcns1O35173 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcns1O35173 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Kcns1O35173 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcns1O35173 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcns1O35173 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcns1O35173 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcns1O35173 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcns1O35173 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcns1O35173 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcns1O35173 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcns1O35173 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcns1O35173 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcns1O35173 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcns1O35173 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcns1O35173 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcns1O35173 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcns1O35173 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcns1O35173 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Kcns1O35173 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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