Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitx3O35160 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitx3O35160 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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