Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Polr1aO35134 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms