Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Kcnk3O35111 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnk3O35111 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms