Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

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Length 796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kif3cO35066 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3cO35066 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms