Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn4O35054 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn4O35054 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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