Protein–RNA interactions for Protein: O09113

Otp, Homeobox protein orthopedia, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtpO09113 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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OtpO09113 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtpO09113 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtpO09113 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtpO09113 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtpO09113 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtpO09113 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtpO09113 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtpO09113 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtpO09113 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtpO09113 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtpO09113 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtpO09113 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtpO09113 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtpO09113 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtpO09113 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtpO09113 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtpO09113 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtpO09113 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtpO09113 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtpO09113 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtpO09113 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtpO09113 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtpO09113 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtpO09113 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtpO09113 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtpO09113 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtpO09113 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtpO09113 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtpO09113 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtpO09113 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtpO09113 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtpO09113 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtpO09113 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtpO09113 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtpO09113 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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OtpO09113 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtpO09113 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtpO09113 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtpO09113 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtpO09113 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtpO09113 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtpO09113 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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OtpO09113 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtpO09113 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtpO09113 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
OtpO09113 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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OtpO09113 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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OtpO09113 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtpO09113 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtpO09113 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtpO09113 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtpO09113 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
OtpO09113 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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OtpO09113 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtpO09113 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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OtpO09113 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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OtpO09113 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtpO09113 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtpO09113 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtpO09113 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtpO09113 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtpO09113 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtpO09113 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtpO09113 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtpO09113 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtpO09113 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtpO09113 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtpO09113 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtpO09113 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtpO09113 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtpO09113 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtpO09113 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtpO09113 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtpO09113 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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OtpO09113 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtpO09113 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OtpO09113 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtpO09113 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtpO09113 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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OtpO09113 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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