Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PbsnO08976 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PbsnO08976 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbsnO08976 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PbsnO08976 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PbsnO08976 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PbsnO08976 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PbsnO08976 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PbsnO08976 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PbsnO08976 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PbsnO08976 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PbsnO08976 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms