Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mesp2O08574 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms