Protein–RNA interactions for Protein: K7N5P2

Gm3402, Predicted gene 3402, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3402K7N5P2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3402K7N5P2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3402K7N5P2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3402K7N5P2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3402K7N5P2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3402K7N5P2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3402K7N5P2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3402K7N5P2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3402K7N5P2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3402K7N5P2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms