Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms