Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gm2035J3QP87 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gm2035J3QP87 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm2035J3QP87 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2035J3QP87 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms